Теоретични аспекти на анализа на заболяванията на храносмилателните органи. Диагностични бактериологични изследвания за стомашно-чревни заболявания Теоретични аспекти на бактериалното изследване на стомашно-чревния тракт

Лоранская И.Д., Лаврентиева О.А.

История на изследване на състава на стомашно-чревната микрофлора тракт(GIT) започва през 1681 г., когато холандският изследовател Антони ван Льовенхук за първи път съобщава за своите наблюдения върху бактерии и други микроорганизми, открити в човешки изпражнения, и изказва хипотеза за съвместното съществуване на различни видове бактерии в стомашно-чревния тракт. тракт. През 1850 г. Луи Пастьор развива концепцията за функционаленролята на бактериите в процеса на ферментация. Немският лекар Робърт Кох продължава изследванията в тази насока и създава техника за изолиране на чисти култури, която дава възможност за идентифициране на специфични бактериални щамове, което е необходимо за разграничаване на патогенни от полезни микроорганизми. През 1886 г. един от основателите на учението за чревниинфекции, описани за първи път от F. Escherich чревнипръчка (Bacterium coli communae). Иля Илич Мечников през 1888 г., докато работи в института Луи Пастьор, твърди, че в черватахората са обитавани от комплекс от микроорганизми, които имат „автоинтоксикационен ефект“ върху тялото, вярвайки, че въвеждането на „здрави“ бактерии в стомашно-чревния тракт може да промени ефекта чревнимикрофлора и противодействат на интоксикацията. Практическото прилагане на идеите на Мечников беше използването на ацидофилни лактобацили за терапевтични цели, което започна в САЩ през 1920-1922 г. Местните изследователи започнаха да изучават този въпрос едва през 50-те години на 20 век. През 1955 г. Peretz L.G. показа това чревни bacillus на здрави хора е един от основните представители на нормалната микрофлора и играе положителна роля поради силните си антагонистични свойства спрямо патогенните микроби. Изследванията върху състава на чревния тракт, започнали преди повече от 300 години, микробиоценоза, неговата нормална и патологична физиология и разработването на начини за положително въздействие върху чревната микрофлора продължават и до днес.

Основни биотопи са: стомашно-чревни тракт(устна кухина, стомах, тънко черво, дебело черво), кожа, дихателни пътища, пикочно-полова система.

Микрофлората на стомашно-чревния тракт е най-представителна, нейната маса при възрастен е повече от 2,5 kg, броят й е 1014. Преди това се смяташе, че съставът микробиоценозаСтомашно-чревният тракт включва 17 семейства, 45 рода и повече от 500 вида микроорганизми. Като се вземат предвид новите данни, получени от изследване на микрофлората на различни стомашно-чревни биотопи с помощта на молекулярно-генетични методи и газо-течна хроматография-масспектрометрия, общият геном на стомашно-чревните бактерии съдържа 400 хиляди гена, което е 12 пъти по-голямо от човешкия геном. Подложени анализза хомология на секвенирани 16S rRNA гени, париетална (мукозна) микрофлора на 400 различни части на стомашно-чревния тракт, получена от ендоскопско изследване на различни части на червата на доброволци. В резултат на изследването беше показано, че париеталната и луминална микрофлора включва 395 филогенетично различни групи микроорганизми, от които 244 са напълно нови. Освен това 80% от новите таксони, идентифицирани по време на молекулярно-генетични изследвания, принадлежат на некултивирани микроорганизми. Повечето от предполагаемите нови филотипове микроорганизми са представители на родовете Firmicutes и Bacteroides. Общият брой на видовете наближава 1500 и изисква допълнително уточняване.

Чрез сфинктерната система стомашно-чревният тракт комуникира с външната среда на заобикалящия ни свят и в същото време чрез чревната стена с вътрешната среда на тялото. Благодарение на тази особеност стомашно-чревният тракт има своя собствена среда, която може да бъде разделена на две отделни ниши: химус и лигавица. Човешката храносмилателна система взаимодейства с различни бактерии, които могат да бъдат обозначени като „ендотрофна микрофлора на човешкия чревен биотоп“. Човешката ендотрофна микрофлора се разделя на три основни групи. Първата група включва еубиотична местна или еубиотична преходна микрофлора, която е полезна за хората; вторият - неутрални микроорганизми, които постоянно или периодично се засяват от червата, но не засягат човешкия живот; третата включва патогенни или потенциално патогенни бактерии („агресивни популации“). В микроекологично отношение стомашно-чревният биотоп може да бъде разделен на нива (устна кухина, стомах, чревни отдели) и микробиотопи (кухинен, париетален и епителен). Възможността за прилагане в париеталния микробиотоп, т.е. Хистаадхезивността (свойството да бъдат фиксирани и да колонизират тъкани) определя същността на преходността или индигенността на бактериите. Тези признаци, както и принадлежността към еубиотична или агресивна група, са основните критерии, характеризиращи микроорганизма, взаимодействащ със стомашно-чревния тракт. Еубиотичните бактерии участват в създаването на колонизационна резистентност на организма, която е уникален механизъм на антиинфекциозната бариерна система. Микробиотопът на кухината в стомашно-чревния тракт е хетерогенен, неговите свойства се определят от състава и качеството на съдържанието на определен слой. Нивата имат свои собствени анатомични и функционаленхарактеристики, следователно съдържанието им се различава по състава на веществата, консистенцията, pH, скоростта на движение и други свойства. Тези свойства определят качествения и количествен състав на микробните популации на кухините, адаптирани към тях. Париеталният микробиотоп е най-важната структура, която ограничава вътрешната среда на тялото от външната. Представлява мукозни отлагания (мукусен гел, муцинов гел), гликокаликс, разположен над апикалната мембрана на ентероцитите и повърхността на самата апикална мембрана. Стенният микробиотоп представлява най-голям интерес от гледна точка на бактериологията, тъй като именно в него се осъществяват полезните или вредните за човека взаимодействия с бактериите - това, което наричаме симбиоза. Днес е известно, че микрофлората на чревната лигавица е значително различна от микрофлората на чревния лумен и изпражненията. Въпреки че червата на всеки възрастен човек са обитавани от определена комбинация от преобладаващи бактериални видове, съставът на микрофлората може да се променя в зависимост от начина на живот, диетата и възрастта. Сравнително изследване на микрофлората при възрастни, които са генетично свързани в една или друга степен, показа, че съставът на чревната микрофлора се влияе повече от генетични фактори, отколкото от храненето.

Нека разгледаме състава на нормалната микрофлора на различни части на стомашно-чревния тракт. Устната кухина и фаринкса извършват предварителна механична и химична обработка на храната и оценяват бактериологичната опасност от проникване на бактерии в човешкото тяло. Слюнката е първата храносмилателна течност, която обработва хранителните вещества и въздейства върху проникващата микрофлора. Общото съдържание на бактерии в слюнката е променливо и е средно 108 MK/ml. Нормалната микрофлора на устната кухина включва стрептококи, стафилококи, лактобацили, коринебактерии и голям брой анаероби. Общо устната микрофлора включва повече от 200 вида микроорганизми. На повърхността на лигавицата, в зависимост от хигиенните продукти, използвани от индивида, се откриват около 103-105 МК/mm2. Колонизационната резистентност на устата се извършва главно от стрептококи (S. salivarus, S. mitis, S. mutans, S. sangius, S. viridans), както и представители на кожата и чревните биотопи. В същото време S. salivarus, S. sangius, S. viridans прилепват добре към лигавицата и зъбната плака. Тези алфа-хемолитични стрептококи, които имат висока степен на хистадезия, инхибират колонизацията на устата от гъбички от рода Candida и стафилококи. Микрофлората, преминаваща временно през хранопровода, е нестабилна, не проявява хистаадхезия към стените му и се характеризира с изобилие от временно присъстващи видове, които навлизат от устната кухина и фаринкса. В стомаха се създават относително неблагоприятни условия за бактериите поради повишената киселинност, влиянието на протеолитичните ензими, бързата моторно-евакуационна функция на стомаха и други фактори, които ограничават техния растеж и възпроизводство. Тук микроорганизмите се съдържат в количества не повече от 102-104 на 1 ml съдържание. Еубиотиците в стомаха колонизират предимно биотопа на кухината; стенният микробиотоп е по-малко достъпен за тях. Основните микроорганизми, активни в стомашната среда, са киселинно устойчиви представители на род Lactobacillus, с или без хистагенна връзка с муцин, някои видове почвени бактерии и бифидобактерии. Лактобацилите, въпреки краткото си време на престой в стомаха, са способни, в допълнение към антибиотичния си ефект в стомашната кухина, временно да колонизират париеталния микробиотоп. В резултат на комбинираното действие на защитните компоненти, по-голямата част от микроорганизмите, които влизат в стомаха, умират. Въпреки това, ако функционирането на лигавицата и имунобиологичните компоненти е нарушено, някои бактерии намират своя биотоп в стомаха. По този начин, поради фактори на патогенност, популацията на Helicobacter pylori се установява в стомашната кухина.

Основните функции на тънките черва включват кухина и париетална хидролиза на храната, абсорбция, секреция и бариерна защита. В последното, освен химичните, ензимните и механичните фактори, съществена роля играе местната микрофлора на тънките черва. Той участва активно в хидролизата на кухините и стените, както и в процесите на усвояване на хранителни вещества. Тънкото черво е една от най-важните връзки, осигуряващи дълготрайното запазване на еубиотичната париетална микрофлора. Има разлика в колонизацията на кухините и париеталните микробиотопи от еубиотична микрофлора, както и колонизацията на нивата по дължината на червата. Микробиотопът на кухината е обект на колебания в състава и концентрацията на микробните популации, докато микробиотопът на стената има относително стабилна хомеостаза. В дебелината на мукозните отлагания се запазват популации с хистахезивни свойства към муцин. Проксималното тънко черво обикновено съдържа относително малки количества грам-положителна флора, състояща се главно от лактобацили, стрептококи и гъбички. Концентрацията на микроорганизми е 102-104 на 1 ml чревно съдържимо. С наближаването на дисталните части на тънките черва общият брой на бактериите нараства до 108 на 1 ml съдържание, като в същото време се появяват допълнителни видове, включително ентеробактерии, бактероиди и бифидобактерии.

Основните функции на дебелото черво са резервът и евакуацията на химуса, остатъчното смилане на храната, отделянето и абсорбцията на вода, абсорбцията на някои метаболити, остатъчен хранителен субстрат, електролити и газове, образуване и детоксикация на изпражненията, регулиране на тяхната екскреция, поддръжка на бариерни защитни механизми. Всички горепосочени функции се изпълняват с участието на чревни еубиотични микроорганизми. Броят на микроорганизмите на дебелото черво е 1010-1012 CFU на 1 ml съдържание. Бактериите представляват до 60% от изпражненията. През целия живот на здравия човек преобладават анаеробните видове бактерии (90-95% от общия състав): бифидобактерии, бактероиди, лактобацили, фузобактерии, еубактерии, вейлонела, пептострептококи, клостридии. От 5 до 10% от микрофлората на дебелото черво са аеробни микроорганизми: Escherichia, Enterococcus, Staphylococcus, различни видове опортюнистични ентеробактерии (Proteus, Enterobacter, Citrobacter, Serration и др.), неферментиращи бактерии (Pseudomonas, Acinetobacter), дрождеподобни. гъбички от рода Candida и др. АнализирамВидовия състав на микробиотата на дебелото черво трябва да се подчертае, че освен посочените анаеробни и аеробни микроорганизми, в състава й влизат представители на родовете непатогенни протозои и около 10 чревни вируса. Два биотопа, различни по анатомични, физиологични и характеристики на околната среда - тънките и дебелите черва - са разделени от ефективно функционираща бариера: баугиновата клапа, която се отваря и затваря, позволявайки на съдържанието на червата да преминава само в една посока и да поддържа замърсяването на чревната тръба в количествата, необходими за здраво тяло. По този начин, въпреки че бактериалното съдържание в устата може да бъде доста високо - до 106 CFU / ml, то намалява до 0-10 CFU / ml в стомаха, повишавайки се до 101-103 в йеюнума и 105-106 в дисталния илеум , с последващо рязко увеличаване на количеството микробиота в дебелото черво, достигащо ниво от 1012 CFU/ml в дисталните му отдели. Тъй като съдържанието се движи вътре в чревната тръба, парциалното налягане на кислорода намалява и стойността на pH на околната среда се увеличава, поради което се появява вертикално разпределение на различни видове бактерии: аеробите са разположени най-високо, факултативните анаероби са по-ниски и строгите анаероби са още по-ниски.

Доказано е, че микрофлората може да повлияе на сензомоторната функция на червата в три посоки:

чрез крайните продукти на бактериалната ферментация и метаболизъм,

невроендокринни фактори

имунни медиатори.

Бактериалните пептиди стимулират чревната нервна система и аферентната инервация, а ендотоксините (липополизахариди) могат да повлияят на чревната подвижност. Метаболитните продукти на захаролитичните бактерии - късоверижни мастни киселини (SCFA), като бутират, ацетат, пропионат, играят важна роля в поддържането на нормалната чревна функция и могат да бъдат включени в патогенезата на стомашно-чревни заболявания. SCFA са важни източници на енергия, необходима за колоноцитите. Поддържането на анаеробни условия в дебелото черво също се осъществява с помощта на микробни метаболити.

SCFA влияят върху производството на серотонин, мотилин и соматостатин, съдържащи се в ентероендокринните клетки на дебелото черво и илеума; те са ключови медиатори на чревната подвижност. Микрофлората е важна за нормалното развитие на чревната имунна система и лимфоидната тъкан. Значението на имунната система в регулацията на сензомоторната функция на червата също не бива да се подценява.

Има хистохимични, морфологични, молекулярно-генетични методи за изследване на микроорганизми, стрес тестове.

Най-често срещаният метод е бактериологичното изследване на изпражненията. По правило броят на определяните показатели варира от 14 до 25. Предимството на метода е точната проверка на патогенните бактерии. Недостатъците на метода включват възможността за получаване на фалшиво положителни и фалшиво отрицателни резултати поради хетерогенността на изолирането на микроорганизми от различни участъци на изпражненията и трудността на култивирането на анаеробни микроорганизми. Освен това се определя кухината и транзитната флора, която доминира във фекалната флора, докато париеталната флора не се оценява.

Алтернатива на бактериологичните изследвания могат да бъдат хроматографски методи за диференциране на микроорганизми - газ-течност, йонообменна и по-специално газо-течна хроматография (GLC) в комбинация с масспектрометрия (MS) - GLC-MS. Методът GLC-MS се основава на определянето на компонентите на бактериалните клетки, които се появяват в резултат на тяхната естествена смърт или атака от компоненти на имунната система. Като маркери се използват второстепенни липидни компоненти на микробните мембрани. Въз основа на съдържанието и количеството им в рамките на няколко часа могат да се определят до 170 вида аеробни и анаеробни бактерии и гъбички в различни биологични среди.

Разработен е и се прилага в практиката метод за GLC анализ, базиран на определянето на SCFAs, които са метаболити на предимно анаеробни родове микроорганизми. Въз основа на получените данни е създаден метаболитен паспорт за чревна еубиоза. Методът ви позволява бързо и точно да оцените състоянието на местната микрофлора.

Бактериалният свръхрастеж на тънките черва (SIBO) включва анормален растеж (повече от 105 CFU/ml) на ендогенни бактерии в тънките черва, подобни на тези, които обикновено се срещат в дебелото черво. За диагностициране на SIBO се използват директни и косвени методи. Директно включва инокулиране на съдържанието на дванадесетопръстника и йеюнума, получено с помощта на стерилна сонда. Косвен метод включва изследване на водородни емисии - дихателен тест. Обосновката за създаването на водороден дихателен тест беше фактът, че по време на метаболизма на въглехидратите от микрофлората на дебелото черво се образува голямо количество газове, включително водород. Водородният тест може да се използва, за да се даде приблизителна представа за степента на бактериално замърсяване на тънките черва. Наскоро обаче се появи мнение, че водородният дихателен тест може да определи само ороцекалния транзит на бактерии.

Понастоящем методът за определяне на видовете микроорганизми с помощта на полимеразна верижна реакция (PCR) стана широко разпространен. PCR методът е разработен още през 1983 г. от Кари Мълис, за което той получава Нобелова награда за химия през 1993 г. PCR методът се основава на многократно копиране (амплифициране) на желания ДНК фрагмент с помощта на ензима ДНК полимераза. В сравнение с традиционните диагностични методи PCR е много чувствителен и специфичен. Позволява използването за диагностика на проби с по-малко строги изисквания за жизнеспособността на изследваните микроорганизми, отколкото за изследване с микробиологични методи. Днес има по-усъвършенстван PCR метод от "класическия" - с откриване на резултатите в реално време. Този метод се основава на автоматично измерване на нивото на флуоресцентния сигнал, което се увеличава с всеки цикъл по време на положителна PCR реакция, което позволява количествена оценка на ДНК на изследвания микроорганизъм в биологична проба.

Еволюцията на хората и животните протича в постоянен контакт със света на микробите, в резултат на което се формират близки взаимоотношения между макро- и микроорганизмите. Влиянието на стомашно-чревната микрофлора върху поддържането на човешкото здраве, неговия биохимичен, метаболитен и имунен баланс е несъмнено и е доказано от голям брой експериментални разработки и клинични наблюдения. Ролята му в генезиса на много заболявания продължава да се изучава активно (атеросклероза, затлъстяване, синдром на раздразнените черва, неспецифични възпалителни заболявания на червата, целиакия, колоректален рак и др.). Следователно проблемът за коригиране на нарушенията на микрофлората всъщност е проблем за запазване на човешкото здраве и създаване на здравословен начин на живот.

Трябва да се помни, че дисбиотичните разстройства винаги са вторични. Следователно, премахване на причините, лечение на основното заболяване, срещу което се развиват нарушенията микробиоценозачервата, е един от водещите принципи на корекцията му. Наред с ефекта върху основното заболяване и повишаването на устойчивостта на организма, корекцията на дисбиотичните нарушения показва: нормализиране на чревната двигателна функция, употребата на ентеросорбенти, предписването на антибактериални лекарства, пре- и пробиотици и синбиотици.

Бактистатин®, комплексно лекарство от естествен произход, иновативен ентеросорбент с пробиотичен ефект, използван в съвременната клинична практика, притежава тези свойства.

Лекарството Baktistatin® се състои от три компонента, които взаимно усилват ефектите си. Основата на лекарството е стерилизирана културална течност на естествения микроб Bacillus Subtilis с високи медицински и биологични свойства, съдържаща пробиотични вещества (лизозим, бактериоцини, каталази), ензими и аминокиселини. Бактерицидният и бактериостатичен ефект върху патогенни и условно патогенни микроби се дължи на съдържанието на пробиотични вещества, синтезирани по време на вегетативния растеж на бактериите от щам B. Subtilis и тяхната концентрация в културалната течност по време на ферментацията. По този начин пробиотичните съединения в Bactistatin® осигуряват възстановяване на нормалната чревна микрофлора и повишават неспецифичната резистентност на организма.

Вторият компонент е зеолит, естествен сорбент с йонообменни свойства. Зеолитът може да проявява сорбционни свойства предимно по отношение на съединения с ниско молекулно тегло (метан, сероводород, амоняк и други токсични вещества), без да влиза в пряко взаимодействие с витамини, аминокиселини, протеини, оставяйки ги в стомашно-чревния тракт. тракт. Йоните, съдържащи се в тялото, могат да бъдат включени в кристалната структура на минерала и, обратно, от минерала тялото получава онези неорганични елементи, от които се нуждае. Получава се така нареченият селективен йонообмен. Зеолитите помагат за нормализиране на метаболизма на мазнините, протеините и въглехидратите; повишаване на имунитета; повишаване на устойчивостта на стрес; подобряване на репродуктивната функция, функцията на чернодробните клетки; нормализира чревната подвижност, ускорява движението на чревното съдържание през храносмилателния тракт тракт.

Bactistatin® съдържа и хидролизат от соево брашно, който е естествен източник на пълноценни протеини, аминокиселини, олигозахариди и осигурява най-благоприятните условия за неконкурентен растеж на нормалната флора и възстановяване на микробния пейзаж на тялото.

Bactistatin® е особено ефективен за нормализиране на чревната микрофлора при остри и хронични стомашно-чревни заболявания със симптоми на дисбактериоза, при дисбактериоза, протичаща със синдром на раздразнените черва, в резултат на антибиотична терапия и след чревни инфекции.

Литература

1. Барановски А.Ю., Кондрашина Е.А. Дисбактериоза и чревна дисбиоза. - Санкт Петербург: Питър. - 2000. - С.17

2. Бондаренко В.М., Мацулевич Т.В. Чревна дисбиоза като клиничен и лабораторен синдром: актуално състояние на проблема. - М .: Издателска група "GEOTAR-Media". - 2007. - С.8-35

3. Григориев А.В. Стомашно-чревният тракт като местообитание за бактерии // Раздел 1. - М.: Издател: ZAO "SILMA". - 2004.- С.5-7, С.16-32

4. Коровина Н.А., Захарова И.Н., Костадинова В.Н. и др.. Пребиотици и пробиотици при чревни разстройства микробиоценозапри деца. - М.: Издателство "Медпрактика-М". - 2004. - С.8-9

5. Ткаченко Е.И., Успенски Ю.П. хранене, микробиоценозаи човешката интелигентност. - Санкт Петербург: СпецЛит. - 2006. - С.110-113

6. Урсова Н.И. Съвременни технологии за корекция на дисбактериозата при деца. - Урок. - Москва. - 2003. - С.4-6.

7. Eckburg P.B., Bik E.M., Bernstein C.N. и др. Разнообразие на чревната микробна флора на човека. // Наука. 2005. - 308.- Р.1635-1638.

8. Ghoshal U.C., Park H., Gwee K.-A. Болести и синдром на раздразнените черва: доброто, лошото и грозното. // J Гастроентерология, Хепатология. - 2010. - 25 (2). - С.244-251.

9. O’Hara A.M., Shanahan F. Review. Чревна микрофлора: анализтерапевтичен потенциал. // Клинична гастроентерология и хепатология. Руско издание. - 2008.- Том 1, № 4: 236-247.

10. Spiller R.S. Статия за преглед: Пробиотици и пребиотици при синдром на раздразнените черва // Хранителна фармакология и терапия. 2008 г.; 28(4):385-396.

Острите чревни инфекции (ОИ) са широко разпространени в целия свят и се характеризират с фекално-орално (хранително, водно) или битово разпространение и първична локализация на патогена в червата. Това са полиетиологични заболявания, чиито причинители принадлежат към различни групи микроорганизми (бактерии, гъбички, вируси, протозои).

Бактериалните патогени на остри чревни инфекции включват представители на следните семейства:

1.Enterobacteriaceae :

Род Шигела , чиито представители причиняват антропонозна инфекция - дизентерия.

Род Салмонела , чиито представители причиняват антропонозни инфекции - коремен тиф и паратифи А и В и зооантропонози - салмонелози.

Род Ешерихия

Диарогенен д. коли, причиняващи ешерихиоза.

Род Йерсиния , причиняващ чревна йерсиниоза и псевдотуберкулоза.

Бактерии нещо като Клебсиела spp, Протей spp, Enterobacter spp, Citrobacter spp - причиняващи хранителни заболявания.

2. Vibrionaceae

Род Вибрион - V. холера 0,1 или 0139, причиняващи холера и опортюнистични вибриони, причинители на вибриогенна диария.

3. Camphylobacteriaceae

РодКамфилобактер (° С. йеюни, ° С. колии т.н.),причиняващи зооантропонози - кампилобактериоза. Род Хеликобактер (з. pylori, свързани с язви на стомаха и дванадесетопръстника).

4. Baccililaceae.

Род Бацил (б . цереус, причинявайки хранително отравяне).

5. Clostridiaceae

РодClostridium (СЪС.ботулинов, ° С. difficilaд)- причиняване на индуциран от антибиотици псевдомембранозен ентероколит.

6. Стафилококи

Род Стафилококи (С. Ауреус), произвеждащи ентеротоксин. Когато голямо количество ентеротоксин навлезе в тялото с храна, се развива стафилококова хранителна токсикоза.

Вируси- причинители на остри чревни инфекции са ротавируси, вирус Norwalk, някои серовари на аденовируси, ентеровируси, включително вирус на хепатит А и вирус на хепатит Е.

Нормална стомашно-чревна микрофлора

Има своеобразно разпределение на микрофлората в храносмилателната система. В целия стомашно-чревен тракт се разграничават няколко биотопа, които се различават значително по състава на микробиоценозата, което е свързано с различни морфологични, функционални и биохимични характеристики на съответните отдели на стомашно-чревния тракт.

хранопровод.Микрофлората на хранопровода е бедна. Проксималната част е замърсена с бактерии, характерни за микрофлората на устната кухина и фаринкса, в дисталните части може да се открие Staphylococcus spp., дифтероиди, Sarcina spp.б. subtilis, гъби от род Кандида.

Стомах.В стомаха практически няма бактерии, техният брой не надвишава 10 3 ml съдържание. Това се дължи на действието на солна киселина, лизозим и ензими. В пилорната част се откриват голям брой бактерии. Представен е видовият състав Лактобацилус spp, Bifidobacterium spp, Bacteroides spp, Streptococcus spp, дрождеподобни гъбички, Sarcina spp, Enterococcus spp, Pseudomonas spp, Bacteroides spp.

червата.В дванадесетопръстника броят на бактериите е не повече от 10 4 - 10 5 CFU на 1 ml съдържание. Представена микрофлора Lactobacillus spp, Bifidobacterium spp, Bacteroides spp, Enterococcus spp.Някои от тях идват с хранителни маси, други от горните части на тънките черва.

В горните части на тънките черва се откриват микроорганизми в малко количество от 10 4 CFU/ml. Основният механизъм, който предотвратява развитието на бактерии в тънките черва, е действието на жлъчката, ензимите, чревната перисталтика и секрецията на имуноглобулини в чревния лумен. С придвижването към дисталната част на тънките черва ефектът на бактерицидните и бактериостатичните фактори отслабва и се създават благоприятни условия за бактериите на входа на дебелото черво (определено pH, температура, много хранителни субстрати), което допринася за интензивното им развитие. размножаване. Във връзка с това и наличието на голям брой продукти на разпадане, постоянната нормална микрофлора на дебелото черво при възрастни е на първо място по брой (10 11 - 10 12 CFU / g изпражнения) и разнообразие (повече от 100 различни вида микроорганизми постоянно)

Тъй като в този биотоп при здрав човек се създават анаеробни условия, в състава на нормалната микрофлора в дебелото черво преобладават (96-99%), анаеробни бактерии-бактероиди, ° С.Rerfringens, Стрептокок spp, Fubacterium spp, Veilonella spp,Джемела spp, Peptostreptococcus spp.Лактобацилус spp, само до 4% от микрофлората са аеробни факултативно анаеробни микроорганизми д. коли, Enterobacteriaceae spp., в малки количества Staphylococcus spp, Proteus spp, Pseudomonas spp, гъбички от род Candida spp, отделни видове трепонема spp, Mycobacterium spp, Mycoplasma spp, Actinomyces spp,протозои и вируси.

Жлъчни пътища. Черен дроб.При здрави хора микробите обикновено отсъстват от жлъчните пътища.

Неспецифични стомашно-чревни заболявания

Неспецифични стомашно-чревни заболявания - диария, неспецифичен колит, синдром на лоша сорбция, дуоденит, стомашна язва, гастрит, гастроентерит, холангит, холецистит, езофагит. Те често се свързват с ентеровируси, ротавируси, амебиаза, балантидиаза, млечница и чревна кандидоза.

Микробиология на гастроентероколит- възпаление на лигавицата на стомаха и тънките черва. Етиологичният фактор е Enterobacterium spp, Staphylococcus spp, Clostridium spp, Bacillus spp, Camphyloбактерия spp, Йерсиниа spp,Vibrio spp, ротавируси, ентеровируси.

Микробиология на гастрита- увреждане на стомашната лигавица, придружено от дисфункция . Свързани са гастрит, язва на стомаха и дванадесетопръстника сз. pylori.

Микробиология на езофагита -възпаление на лигавицата на хранопровода. Основен патоген ° С. албиканс, херпес симплекс вируси, цитомегаловируси.

Микробиология на холецистита- възпаление на жлъчния мехур, предимно от бактериален произход ( д . коли , С. ауреус, Ентерококи spp, Streptococcus spp, Proteus spp, дрождеподобни гъбички, смесена флора.).

Микробиологична диагностика.Основният метод за микробиологична диагностика на острите чревни инфекции е бактериологичното изследване.

Колекция от материали:

Изпражненията се събират в стерилни контейнери при спазване на асептични правила. В случай на естествена дефекация, събирането се извършва от пелени или от саксия със стерилна шпатула, монтирана в памучна запушалка на епруветка;

Фекална материя може да се вземе от ректума с помощта на ректална тръба, която се вкарва на 8-10 cm;

При профилактичен преглед на здрави хора за носителство на тиф-паратиф, 3 часа преди началото на събирането на материала на пациента трябва да се дадат 25-30 g магнезиев сулфат, който е холеретик и слабително;

Материалът се събира при появата на първите признаци на заболяването, преди да започне антибиотично лечение. Препоръчително е да се извърши събирането и първоначалното засяване на материала в спешното отделение, той трябва да бъде доставен в лабораторията не по-късно от 2 часа след събирането, в противен случай трябва да се съхранява в хладилник. Ако не е възможно незабавно посяване, събраният материал се поставя в епруветки с консервиращ разтвор;

Транспортирането трябва да се извършва при спазване на необходимите правила за повишено внимание - в чанти, моливи;

При езофагоскопия и гастроскопия се взема материал от хранопровода и стомаха;

Съдържанието на тънките черва се събира с помощта на сонда. Пробата се изследва не по-късно от час след вземането й;

При чревна ешерихиоза- това са изпражнения, материал от розеола, урина, жлъчка, повръщане;

При парентерална ешерихиоза- гноен секрет, урина, храчки, кръв в септични форми;

Тиф-паротидни инфекции, изборът на материал се определя от фазата на патогенезата:

Фаза на бактериемия (1 седмица) кръв,

Височината на заболяването (2,3 седмици): кръв, пункция на костен мозък, остъргване на розеола;

Екскреторно-алергична фаза (4-та седмица): кръв (при рецидив), изпражнения, урина, жлъчка;

жлъчкатасъбрани в стерилни епруветки чрез сондиране на дванадесетопръстника. В този случай дуоденалното съдържимо, кистозната жлъчка и жлъчката от жлъчните пътища се събират отделно (партида A, B, C);

- розеоласкарифициране, взетият материал се инокулира върху жлъчен бульон;

Вземане на урина, ликвор, биопсии на костен мозък, храчки – описани в съответните раздели.

Микробиологична диагностика

Лабораторното изследване на изпражненията започва с предварително капрологично изследване, за което е необходимо:

Подгответе петна от изпражнения, оцветете ги с метиленово синьо, за да идентифицирате левкоцитите, което показва увреждане на чревната лигавица;

Извършете микроскопски анализ на нативна фекална намазка за червеи, тъй като хелминтиазите могат да възникнат с клиничната картина на остри чревни инфекции;

Извършете микроскопски анализ на протозои (амеба, ламблия, криптоспоридиум).

Бактериологично изследване на изпражненията при съмнение за остри чревни инфекции

Характеристики на събитието 1-ви етапБактериологичното изследване при съмнение за остри чревни инфекции се състои от следното:

Не се извършва първична микроскопия на фекални натривки;

Като се има предвид полиетиологията на OCI, за да се изолира чиста култура, се извършва сеитба на разреждания на изпражненията върху диференциално диагностични среди (Endo, Levin, Ploskireva, бисмут-сулфитен агар и обогатителни среди).

На етап 2бактериологично изследване

Селектират се порасналите колонии с отрицателен ефект върху лактозата (безцветни). Образуват се от салмонела, шигела;

Лактозо-позитивните (оцветени) колонии, които са дали Escherichia, се отстраняват внимателно с примка и с тях се извършва реакция на аглутинация с комплексен поливалентен Escherichia серум за различни патогенни серогрупи. Колониите, при които е регистриран положителен резултат, когато реагират с подходящия серум, се отсяват за натрупване върху наклонен агар.

Натрупаната култура се идентифицира към род и вид въз основа на набор от биохимични свойства:

В случай на съмнение за йерсиниоза, първичната инокулация се извършва върху среда на Серов, последвано от студено обогатяване (инокулациите се поставят в хладилник, последвано от засяване върху твърди хранителни среди);

Ако се подозира кампилобактериоза, първичното засяване се извършва върху специални хранителни среди с добавяне на антибиотици. Културите се инкубират в анаеростати;

За бактериологична диагностика на холера материалът от пациента се инокулира върху елективна среда (1% пептонна вода, алкален агар);

За диагностициране на заболявания, причинени от ° С. труденекзотоксин се намира в изпражненията на пациентите. Използват се ELISA или молекулярно-генетични методи.

Ако има съмнение за заболяване, причинено от храна, първоначалното засяване на материала се извършва върху няколко специфични среди:

Засяване върху среда Endo - за изолиране на ентеробактерии;

Засяване според Shchukevich - за изолиране на Proteus;

Засяване върху ZhSA - за изолация С. ауреус,

Култура върху кръвен агар за изолиране на стрептококи;

Засяване върху среда Kitt-Tarrotsi за изолиране на анаероби.

Засяване върху среда на Сабуро за изолиране на гъбички.

За микробиологична диагностика на остри чревни инфекции се използва и: серодиагностика -често се извършва ретроспективно.

Имуноиндикация -имунофлуоресцентна реакция, латексна аглутинация, коаглутинация.

В проксималната малки количества бактерии могат да бъдат намерени в части от хранопровода, живеещи в орофаринкса, в дисталните отдели - стафилококи, дифтероиди, млечнокисели бактерии, сарцина, Bacillus subtilis и кандида. Провежда се бактериологично изследване за идентифициране на причинителите на езофагит. Основните патогени са HSV, CMV и гъбички от рода Candida.

За херпесна инфекцияпоказват дълбоки множество малки язви; с CMV инфекция те са по-големи и склонни към сливане. Кандидозният езофагит е типичен за пациенти с тежки имунодефицитни състояния. За да се изолира кандида, по време на езофагоскопия се вземат биопсии, оцветените по Грам петна се изследват микроскопски и материалът се посява върху хранителни среди.

Бактериологично изследване на стомаха

Бактерии в стомахапрактически липсват или количеството им не надвишава 10 3 -10 4 ml съдържание, което се дължи на киселинното pH. По-голям брой бактерии се откриват в пилорната част. При хипохлорхидрия в стомаха се откриват лактобацили, сарцина, ентеробактерии, Pseudomonas aeruginosa, ентерококи, спорообразуващи бацили и различни гъбички. От особено значение е Helicobacter pylori, причинителят на рецидивиращ улцерозен гастродуоденит.

За откриване на H. pyloriВземането на биопсични проби по време на фиброгастроскопия се счита за най-оптимално. При хранителни болестипричинени от S. aureus и B. cereus, се изследват стомашни промивни води, които се изследват незабавно. Пробите се центрофугират, утайката се изследва под микроскоп и се инокулира върху хранителни среди. Ако незабавният анализ не е възможен, pH на пробите се регулира до неутрални стойности и се замразява. Повръщането се доставя в лабораторията върху лед; При необходимост могат да се замразят.

ОСНОВНИ ФУНКЦИИ НА НОРМАЛНАТА МИКРОФЛОРА НА ЧРЕВНИЯ ТРАКТ

Нормалната микрофлора (нормофлора) на стомашно-чревния тракт е необходимо условие за живота на организма. Микрофлората на стомашно-чревния тракт в съвременното разбиране се разглежда като човешкия микробиом...

Нормофлора(микрофлора в нормално състояние) илиНормално състояние на микрофлората (еубиоза) - то е качествено и количественосъотношението на различни микробни популации на отделни органи и системи, поддържащи биохимичния, метаболитен и имунологичен баланс, необходим за поддържане на човешкото здраве.Най-важната функция на микрофлората е нейното участие във формирането на устойчивостта на организма към различни заболявания и предотвратяване на колонизацията на човешкото тяло от чужди микроорганизми.

Стомашно-чревният тракт е една от най-сложните микроекологични среди на човешкото тяло, в която на общата площ на лигавицата, която е около 400 m2, има изключително голямо и разнообразно разнообразие (над 1000 вида)разнородни бактерии, вируси, археи и гъбички - изд.) плътността на микробното замърсяване, при което взаимодействието между защитните системи на макроорганизма и микробните асоциации е много фино балансирано. Смята се, че бактериите съставляват 35 до 50% от обема на човешкото дебело черво, а общата им биомаса в стомашно-чревния тракт достига 1,5 kg.Бактериите обаче са неравномерно разпределени в стомашно-чревния тракт. Ако плътността на микробната колонизация в стомаха е ниска и е само около 10 3 -10 4 CFU/ml, а в илеума - 10 7 -10 8 CFU/ml, тогава вече в областта на илеоцекалната клапа в дебелото черво градиентът на бактериалната плътност достига 10 11 -10 12 CFU/ml. Въпреки такова голямо разнообразие от бактериални видове, живеещи в стомашно-чревния тракт, повечето могат да бъдат идентифицирани само молекулярно генетично.

Освен това във всяка микробиоценоза, включително чревната, винаги има постоянно живеещи видове микроорганизми - 90% , свързани с т.нар облигатна микрофлора ( синоними:основна, автохтонна, местна, резидентна, облигатна микрофлора), която има водеща роля в поддържането на симбиотичната връзка между макроорганизма и неговата микробиота, както и в регулацията на междумикробните взаимоотношения, а има и допълнителни (съпътстваща или факултативна микрофлора) - около 10% и преходни (случайни видове, алохтонна, остатъчна микрофлора) - 0,01%.

Основен видовечревната микробиота са Firmicutes, Bacteriodetes, Actinobacteria, Proteobacteria, Fusobacteria, Verrucomicrobia, TenericutesИ Lentisphaerae.

Сред коменсалните бактерии, култивирани от стомашно-чревния тракт, повече от 99,9% са облигатни анаероби, от които доминиращите са раждане : Bacteroides, Bifidobacterium, Eubacterium, Lactobacillus, Clostridium, Faecalibacterium, Fusobacterium, Пептококи, Пептострептокок, Ruminococcus, Стрептокок, ЕшерихияИ Вейлонела. Съставът на откритите бактерии в различните части на стомашно-чревния тракт е много променлив.

Нараства плътностмикроорганизми и биологично разнообразие от видове се наблюдава по стомашно-чревния тракт в каудално-цервикална посока. Наблюдават се и разлики в състава на червата между чревния лумен и повърхността на лигавицата. Преобладаващи са Bacteroides, Bifidobacterium, Streptococcus, Enterococcus, Clostridium, Lactobacillus и Ruminococcus ражданев чревния лумен, докато Clostridium, Lactobacillus, Enterococcus и Akkermansia преобладават на повърхността, свързана с лигавицата - т.е. ТоваИмикробиота, съответно (или по друг начин - луминален и мукозен). Свързаната с лигавицата микробиота играе много важна роля в поддържането на хомеостазата, като се има предвид нейната близост до чревния епител и основната мукозна имунна система [3 ]. Тази микробиота може да играе важна роля в поддържането на клетъчната хомеостаза на гостоприемника или в задействането на възпалителни механизми.

След като този състав се установи, чревната микробиота остава стабилна през целия живот на зряла възраст. Наблюдавани са някои разлики между чревната микробиота на по-възрастни и по-млади възрастни, най-вече по отношение на преобладаването раждане Bacteroides и Clostridium при възрастни хора и ТипФирмикути при млади хора. Предложени са три варианта на човешката чревна микробиота, класифицирани като ентеротиповевъз основа на вариации в нивата на едно от трите раждане: Bacteroides (ентеротип 1), Prevotella (ентеротип 2) и Ruminococcus (ентеротип 3). Тези три вариации изглеждат независими от индекса на телесна маса, възрастта, пола или етническата принадлежност [, ].

В зависимост от честотата и последователността на откриване на бактерии, цялата микрофлора се разделя на три групи (Таблица 1).

Таблица 1. Микробиоценоза на стомашно-чревния тракт.

Подобно разделение обаче е изключително произволно. Директно в дебелото червоПри хората бактериите от родовете Actinomyces, Citrobacter, Corynebacterium, Peptococcus, Veillonella, Acidominococcus, Anaerovibrio, Butyrovibrio, Acetovibrio, Campylobacter, Disulfomonas, Roseburia, Ruminococcus, Selenomonas, Spirochetes, Succinomonas, Wolinella присъстват в различни количества. В допълнение към тези групи микроорганизми, можете да намерите представители на други анаеробни бактерии (Gemiger, Anaerobiospirillum, Metanobrevibacter, Megasphaera, Bilophila), различни представители на непатогенни протозойни родове Chilomastix, Endolimax, Entamoeba, Enteromonas) и повече от десет чревни вируси (повече от 50% от здравите хора имат едни и същи 75 вида бактерии, а повече от 90% от бактериите на дебелото черво принадлежат към вида Bacteroidetes и Firmicutes - Qin, J.;et al. Каталог на човешки чревни микробни гени, установен чрез метагеномно секвениране.Природата.2010 , 464 , 59-65.).

Както беше отбелязано по-горе, разделянето на стомашно-чревните микроорганизми на групи с „постоянство и важност“ е много произволно. Науката не стои неподвижна, като се има предвид появата на нови независими от културата методи за идентифициране на микробиота (секвениране на ДНК, флуоресцентна in situ хибридизация (РИБА), използването на технологията Illumina и др.) и прекласификацията на редица микроорганизми, извършена във връзка с това, възгледът за състава и ролята на здравата чревна микробиота на човека се промени значително. Както се оказа, съставът на стомашно-чревния микробиом зависи отчовекаксесоари. Появи се и нова идея за доминиращия вид - рафиниран филогенетично дървомикробиота на човешкия стомашно-чревен тракт (за това и повече вижте раздели "" & " ".

Съществува тясна връзка между колониите от микроорганизми и чревната стена, което им позволява да бъдат комбинирани в едномикробно-тъканен комплекс, който се образува от микроколонии от бактерии и метаболитите, които произвеждат, слуз (муцин), епителни клетки на лигавицата и техния гликокаликс, както и стромални клетки на лигавицата (фибробласти, левкоцити, лимфоцити, невроендокринни клетки, микроциркулаторни клетки и т.н.). Необходимо е да се помни съществуването на друга популационна част от микрофлората -коремна(или както е посочено по-горе - светещ), което е по-променливо и зависи от скоростта на навлизане на хранителните субстрати през храносмилателния канал, по-специално диетичните фибри, които са хранителен субстрат и играят ролята на матрица, върху която чревните бактерии се фиксират и образуват колонии. Кухина (луминална)Флора доминира във фекалната микрофлора, което налага да се оценяват изключително внимателно промените в различни микробни популации, открити по време на бактериологично изследване.

Стомахът съдържа малко микрофлора, много повече в тънките черва и особено много в дебелото черво. Заслужава да се отбележи, че засмукванемастноразтворимивещества, най-важното Витамините и микроелементите се намират главно в йеюнума. Поради това системното включване в диетата на пробиотични продукти и хранителни добавки, коитомодулират чревната микрофлора (микробиота), регулирайки процесите на чревна абсорбция,се превръща в много ефективно средство за профилактика и лечение на хранителни заболявания.

Чревна абсорбция- това е процесът на навлизане на различни съединения през слой клетки в кръвта и лимфата, в резултат на което тялото получава всички необходими вещества.

Най-интензивната абсорбция се извършва в тънките черва. Поради факта, че малките артерии, разклонени в капиляри, проникват във всяка чревна власинка, абсорбираните хранителни вещества лесно проникват в телесните течности. Глюкозата и протеините, разградени на аминокиселини, се абсорбират в кръвта посредствено. Кръвта, носеща глюкоза и аминокиселини, се изпраща в черния дроб, където се отлагат въглехидрати. Мастните киселини и глицеролът - продукт на преработката на мазнини под въздействието на жлъчката - се абсорбират в лимфата и оттам навлизат в кръвоносната система.

На снимката вляво(диаграма на структурата на въси на тънките черва): 1 - колонен епител, 2 - централен лимфен съд, 3 - капилярна мрежа, 4 - лигавица, 5 - субмукозна мембрана, 6 - мускулна пластина на лигавицата, 7 - чревна жлеза, 8 - лимфен канал .

Едно от значенията на микрофлората дебело червое, че участва в окончателното разграждане на несмлени остатъци от храна.В дебелото черво храносмилането завършва с хидролиза на несмлени остатъци от храна. По време на хидролизата в дебелото черво участват ензими, които идват от тънките черва и ензими от чревни бактерии. Настъпва абсорбция на вода, минерални соли (електролити), разграждане на растителни влакна и образуване на изпражнения.

Микрофлораиграе значителна (!) роля вперисталтика, секреция, абсорбция и клетъчен състав на червата. Микрофлората участва в разграждането на ензими и други биологично активни вещества. Нормалната микрофлора осигурява колонизационна резистентност - защита на чревната лигавица от патогенни бактерии, потискане на патогенните микроорганизми и предотвратяване на инфекции на тялото.Бактериалните ензими разграждат неусвоените вещества в тънките черва. Чревната флора синтезира витамин К и витамини от група В, редица незаменими аминокиселинии необходимите за организма ензими.С участието на микрофлората в организма се извършва обмяната на протеини, мазнини, въглероди, жлъчни и мастни киселини, холестерол, прокарциногените (вещества, които могат да причинят рак) се инактивират, излишната храна се оползотворява и се образуват изпражнения. Ролята на нормалната флора е изключително важна за организма на гостоприемника, поради което нейното нарушаване (дисбактериоза) и развитието на дисбиоза като цяло води до сериозни заболявания от метаболитен и имунологичен характер.

Съставът на микроорганизмите в определени части на червата зависи от много фактори:начин на живот, хранене, вирусни и бактериални инфекции, както и медикаментозно лечение, особено антибиотици. Много стомашно-чревни заболявания, включително възпалителни заболявания, също могат да нарушат чревната екосистема. Резултатът от този дисбаланс са често срещани храносмилателни проблеми: подуване на корема, лошо храносмилане, запек или диария и др.

За повече информация относно ролята на чревния микробиом за поддържане на стомашно-чревното здраве вижте статията: (виж вкл. връзки в долната част на този раздел).

На фигурата: Пространствено разпределение и концентрация на бактерии по стомашно-чревния тракт на човека ( осреднени данни).

Чревната микрофлора (чревния микробиом) е невероятно сложна екосистема. Един индивид има най-малко 17 семейства бактерии, 50 рода, 400-500 вида и неопределен брой подвидове. Чревната микрофлора се разделя на облигатна (микроорганизми, които постоянно са част от нормалната флора и играят важна роля в метаболизма и антиинфекциозната защита) и факултативна (микроорганизми, които често се срещат при здрави хора, но са опортюнистични, т.е. способни да причинят заболявания с намалена устойчивост на макроорганизма). Доминиращите представители на облигатната микрофлора са бифидобактерии.

Таблица 1 показва най-известнитефункции на чревната микрофлора (микробиота), докато нейната функционалност е много по-широка и все още се проучва