Aspecte teoretice ale analizei bolilor organelor digestive. Studii bacteriologice de diagnostic pentru boli gastrointestinale Aspecte teoretice ale cercetării bacteriene a tractului gastrointestinal

Loranskaya I.D., Lavrentieva O.A.

Istoria studierii compoziției microflorei gastrointestinale tract(GIT) a început în 1681, când exploratorul olandez Antonie Van Leeuwenhoek a raportat pentru prima dată observațiile sale despre bacterii și alte microorganisme găsite în fecalele umane și a emis ipoteza coexistenței diferitelor tipuri de bacterii în tractul gastrointestinal. tract. În 1850, Louis Pasteur a dezvoltat conceptul de funcţional rolul bacteriilor în procesul de fermentare. Medicul german Robert Koch a continuat cercetările în această direcție și a creat o tehnică de izolare a culturilor pure, care face posibilă identificarea unor tulpini bacteriene specifice, ceea ce este necesar pentru a face distincția între microorganismele patogene și cele benefice. În 1886, unul dintre fondatorii doctrinei lui intestinal infectii F. Escherich a descris prima data intestinal bastonaș (Bacterium coli communae). Ilya Ilici Mechnikov în 1888, în timp ce lucra la Institutul Louis Pasteur, a susținut că în intestinele oamenii sunt locuiți de un complex de microorganisme care au un „efect de autointoxicație” asupra organismului, crezând că introducerea bacteriilor „sănătoase” în tractul gastrointestinal poate modifica efectul intestinal microflora și contracarează intoxicația. Implementarea practică a ideilor lui Mechnikov a fost utilizarea lactobacililor acidofili în scopuri terapeutice, care a început în SUA în 1920-1922. Cercetătorii autohtoni au început să studieze această problemă abia în anii 50 ai secolului XX. În 1955 Peretz L.G. a aratat ca intestinal bacilul oamenilor sănătoși este unul dintre principalii reprezentanți ai microflorei normale și joacă un rol pozitiv datorită proprietăților sale puternice antagoniste față de microbii patogeni. Cercetări privind compoziția tractului intestinal, începute cu mai bine de 300 de ani în urmă, microbiocenoza, fiziologia sa normală și patologică și dezvoltarea modalităților de a influența pozitiv microflora intestinală continuă și astăzi.

Principalii biotopi sunt: ​​gastrointestinale tract(cavitatea bucală, stomacul, intestinul subțire, intestinul gros), pielea, căile respiratorii, sistemul urogenital.

Microflora tractului gastrointestinal este cea mai reprezentativă, masa sa la un adult este mai mare de 2,5 kg, numărul său este de 1014. Anterior se credea că compoziția microbiocenoza Tractul gastrointestinal include 17 familii, 45 de genuri și peste 500 de specii de microorganisme. Luând în considerare noile date obținute din studierea microflorei diferitelor biotopuri gastrointestinale folosind metode genetice moleculare și cromatografie gaz-lichid-spectrometrie de masă, genomul total al bacteriilor gastrointestinale conține 400 de mii de gene, care este de 12 ori mai mare decât genomul uman. Supus analiză pentru omologia genelor ARNr 16S secvențiate, microflora parietală (mucoasă) a 400 de părți diferite ale tractului gastrointestinal, obținută din examinarea endoscopică a diferitelor părți ale intestinelor voluntarilor. În urma studiului, s-a arătat că microflora parietală și luminală include 395 de grupuri de microorganisme distincte filogenetic, dintre care 244 sunt complet noi. Mai mult, 80% din taxoni noi identificați în timpul cercetării genetice moleculare aparțin microorganismelor necultivate. Cele mai multe dintre noile filotipuri presupuse de microorganisme sunt reprezentanți ai genurilor Firmicutes și Bacteroides. Numărul total de specii se apropie de 1500 și necesită clarificări suplimentare.

Tractul gastrointestinal comunica prin sistemul sfincterian cu mediul extern al lumii din jurul nostru si, in acelasi timp, prin peretele intestinal, cu mediul intern al organismului. Datorită acestei caracteristici, tractul gastrointestinal are propriul mediu, care poate fi împărțit în două nișe separate: chim și membrana mucoasă. Sistemul digestiv uman interacționează cu diferite bacterii, care pot fi denumite „microfloră endotrofică a biotopului intestinal uman”. Microflora endotrofică umană este împărțită în trei grupuri principale. Primul grup include microflora eubiotică indigenă sau eubiotică tranzitorie care este benefică pentru oameni; al doilea - microorganisme neutre care sunt semănate constant sau periodic din intestine, dar nu afectează viața umană; al treilea include bacterii patogene sau potențial patogene („populații agresive”). În termeni microecologici, biotopul gastrointestinal poate fi împărțit în niveluri (cavitatea bucală, stomacul, secțiuni intestinale) și microbiotopi (cavitatea, parietal și epitelial). Capacitatea de a aplica în microbiotopul parietal, adică. Histadezivitatea (proprietatea de a fi fixate și de a coloniza țesuturile) determină esența tranzitoriei sau indigenității bacteriilor. Aceste semne, precum și apartenența la un grup eubiotic sau agresiv, sunt principalele criterii care caracterizează un microorganism care interacționează cu tractul gastrointestinal. Bacteriile eubiotice participă la crearea rezistenței la colonizare a organismului, care este un mecanism unic al sistemului de barieră antiinfecțioasă. Microbiotopul cavitații din tractul gastrointestinal este eterogen; proprietățile sale sunt determinate de compoziția și calitatea conținutului unui anumit nivel. Nivelurile au propriile lor anatomice și funcţional caracteristici, prin urmare conținutul lor diferă în compoziția substanțelor, consistență, pH, viteza de mișcare și alte proprietăți. Aceste proprietăți determină compoziția calitativă și cantitativă a populațiilor microbiene cavitare adaptate acestora. Microbiotopul parietal este cea mai importantă structură care limitează mediul intern al organismului de cel extern. Este reprezentat de depozite mucoase (gel de mucus, gel de mucină), un glicocalix situat deasupra membranei apicale a enterocitelor și a suprafeței membranei apicale însăși. Microbiotopul peretelui prezintă cel mai mare interes din punct de vedere al bacteriologiei, deoarece în el au loc interacțiuni benefice sau dăunătoare cu bacteriile pentru oameni - ceea ce numim simbioză. Astăzi se știe că microflora mucoasei intestinale este semnificativ diferită de microflora lumenului intestinal și a fecalelor. Deși intestinul fiecărui adult este locuit de o anumită combinație de specii bacteriene predominante, compoziția microflorei se poate modifica în funcție de stilul de viață, dietă și vârstă. Un studiu comparativ al microflorei la adulții care sunt înrudiți genetic într-un grad sau altul a relevat că compoziția microflorei intestinale este influențată mai mult de factori genetici decât de nutriție.

Să luăm în considerare compozițiile microflorei normale ale diferitelor părți ale tractului gastrointestinal. Cavitatea bucală și faringele efectuează prelucrarea mecanică și chimică preliminară a alimentelor și evaluează pericolul bacteriologic al bacteriilor care pătrund în corpul uman. Saliva este primul fluid digestiv care procesează substanțele alimentare și afectează microflora pătrunzătoare. Conținutul total de bacterii din salivă este variabil și este în medie de 108 MK/ml. Microflora normală a cavității bucale include streptococi, stafilococi, lactobacili, corinebacterii și un număr mare de anaerobi. În total, microflora orală include peste 200 de tipuri de microorganisme. Pe suprafata mucoasei, in functie de produsele de igiena folosite de individ, se depisteaza aproximativ 103-105 MK/mm2. Rezistența la colonizare a gurii este realizată în principal de streptococi (S. salivarus, S. mitis, S. mutans, S. sangius, S. viridans), precum și reprezentanți ai biotopilor cutanați și intestinali. În același timp, S. salivarus, S. sangius, S. viridans aderă bine la membrana mucoasă și placa dentară. Acești streptococi alfa-hemolitici, care au un grad ridicat de histadeză, inhibă colonizarea gurii de către ciuperci din genul Candida și stafilococi. Microflora care trece tranzitoriu prin esofag este instabilă, nu prezintă histadezivitate la pereții săi și se caracterizează printr-o abundență de specii prezente temporar, care intră din cavitatea bucală și din faringe. În stomac se creează condiții relativ nefavorabile pentru bacterii din cauza acidității crescute, a influenței enzimelor proteolitice, a funcției de evacuare motorie rapidă a stomacului și a altor factori care limitează creșterea și reproducerea acestora. Aici microorganismele sunt conținute în cantități care nu depășesc 102-104 la 1 ml de conținut. Eubioticele din stomac colonizează în primul rând biotopul cavităţii; microbiotopul peretelui le este mai puţin accesibil. Principalele microorganisme active în mediul gastric sunt reprezentanți acido-rezistenți ai genului Lactobacillus, cu sau fără relație histagezivă cu mucina, unele tipuri de bacterii din sol și bifidobacteriile. Lactobacilii, în ciuda timpului lor scurt de rezidență în stomac, sunt capabili, pe lângă efectul lor antibiotic în cavitatea gastrică, să colonizeze temporar microbiotopul parietal. Ca urmare a acțiunii combinate a componentelor de protecție, cea mai mare parte a microorganismelor care intră în stomac mor. Cu toate acestea, dacă funcționarea componentelor mucoase și imunobiologice este perturbată, unele bacterii își găsesc biotopul în stomac. Astfel, din cauza factorilor de patogenitate, populația Helicobacter pylori se stabilește în cavitatea gastrică.

Principalele funcții ale intestinului subțire includ cavitatea și hidroliza parietală a alimentelor, absorbția, secreția și protecția barierei. În aceasta din urmă, pe lângă factorii chimici, enzimatici și mecanici, microflora indigenă a intestinului subțire joacă un rol semnificativ. Acesta are un rol activ în hidroliza cavităților și a peretelui, precum și în procesele de absorbție a nutrienților. Intestinul subtire este una dintre cele mai importante verigi care asigura conservarea pe termen lung a microflorei parietale eubiotice. Există o diferență în colonizarea cavității și microbiotopilor parietali de către microflora eubiotică, precum și colonizarea nivelurilor de-a lungul lungimii intestinului. Microbiotopul cavitar este supus fluctuațiilor în compoziția și concentrația populațiilor microbiene, în timp ce microbiotopul de perete are o homeostazie relativ stabilă. În grosimea depozitelor mucoase se păstrează populații cu proprietăți histaghezive la mucină. Intestinul subțire proximal conține în mod normal cantități relativ mici de floră gram-pozitivă, constând în principal din lactobacili, streptococi și ciuperci. Concentrația de microorganisme este de 102-104 la 1 ml de conținut intestinal. Pe măsură ce ne apropiem de părțile distale ale intestinului subțire, numărul total de bacterii crește la 108 la 1 ml de conținut și, în același timp, apar și alte specii, inclusiv enterobacterii, bacteriide și bifidobacterii.

Principalele funcții ale intestinului gros sunt rezervarea și evacuarea chimului, digestia reziduală a alimentelor, excreția și absorbția apei, absorbția unor metaboliți, substratul nutritiv rezidual, electroliții și gazele, formarea și detoxifierea fecalelor, reglarea excreției acestora, menținerea mecanismelor de protecție a barierelor. Toate funcțiile de mai sus sunt efectuate cu participarea microorganismelor eubiotice intestinale. Numărul de microorganisme de colon este de 1010-1012 CFU per 1 ml de conținut. Bacteriile reprezintă până la 60% din fecale. De-a lungul vieții unei persoane sănătoase predomină specii anaerobe de bacterii (90-95% din compoziția totală): bifidobacterii, bacteroides, lactobacili, fusobacterii, eubacterii, veillonella, peptostreptococi, clostridii. De la 5 la 10% din microflora colonului sunt microorganisme aerobe: Escherichia, Enterococcus, Staphylococcus, diverse tipuri de enterobacterii oportuniste (Proteus, Enterobacter, Citrobacter, Serration etc.), bacterii nefermentante (Pseudomonas, Acinetobacter), drojdii. ciuperci din genul Candida și etc. Analizand compoziția de specii a microbiotei colonului, trebuie subliniat că, pe lângă microorganismele anaerobe și aerobe indicate, compoziția sa include reprezentanți ai genurilor de protozoare nepatogene și aproximativ 10 virusuri intestinale. Două biotopi care diferă în caracteristicile anatomice, fiziologice și de mediu - intestinul subțire și gros - sunt separate printr-o barieră care funcționează eficient: supapa Baugin, care se deschide și se închide, permițând conținutului intestinului să treacă doar într-o singură direcție și menține contaminarea tubului intestinal în cantităţile necesare unui organism sănătos. Astfel, deși conținutul bacterian din gură poate fi destul de mare - până la 106 UFC/ml, acesta scade la 0-10 UFC/ml în stomac, urcând la 101-103 în jejun și 105-106 în ileonul distal. , cu o creștere bruscă ulterioară a cantității de microbiotă din colon, atingând un nivel de 1012 CFU/ml în părțile sale distale. Pe măsură ce conținutul se mișcă în interiorul tubului intestinal, presiunea parțială a oxigenului scade și valoarea pH-ului mediului înconjurător crește, datorită faptului că apare o distribuție verticală a diferitelor tipuri de bacterii: aerobii sunt situati cel mai sus, anaerobii facultativi sunt mai mici și anaerobii stricti. sunt chiar mai mici.

S-a dovedit că microflora poate influența funcția senzoriomotorie a intestinului în trei direcții:

prin produsele finale ale fermentației bacteriene și metabolismului,

factori neuroendocrini

mediatori imunitari.

Peptidele bacteriene stimulează sistemul nervos enteric și inervația aferentă, iar endotoxinele (lipopolizaharide) pot afecta motilitatea intestinală. Produșii metabolici ai bacteriilor zaharolitice - acizii grași cu lanț scurt (SCFA), precum butirat, acetat, propionat, joacă un rol important în menținerea funcției intestinale normale și pot fi implicați în patogeneza bolilor gastrointestinale. SCFA sunt surse importante de energie necesare colonocitelor. Menținerea condițiilor anaerobe în colon se realizează și cu ajutorul metaboliților microbieni.

SCFA influențează producția de serotonină, motilină și somatostatina conținute în celulele enteroendocrine ale colonului și ileonului; sunt mediatori cheie ai motilitatii intestinale. Microflora este importantă în dezvoltarea normală a sistemului imunitar intestinal și a țesutului limfoid. De asemenea, nu trebuie subestimată importanța sistemului imunitar în reglarea funcției senzorio-motorii a intestinului.

Există metode histochimice, morfologice, genetice moleculare pentru studierea microorganismelor și teste de stres.

Cea mai comună metodă este examinarea bacteriologică a scaunului. De regulă, numărul de indicatori determinați variază de la 14 la 25. Avantajul metodei este verificarea precisă a bacteriilor patogene. Dezavantajele metodei includ posibilitatea de a obține rezultate fals-pozitive și fals-negative datorită eterogenității izolării microorganismelor din diferite secțiuni de fecale și dificultății cultivării microorganismelor anaerobe. În plus, se determină flora cavităţii şi de tranzit, care domină flora fecală, în timp ce flora parietală nu este evaluată.

O alternativă la studiile bacteriologice pot fi metodele cromatografice de diferențiere a microorganismelor - gaz-lichid, schimb de ioni și, în special, cromatografia gaz-lichid (GLC) în combinație cu spectrometria de masă (MS) - GLC-MS. Metoda GLC-MS se bazează pe determinarea componentelor celulelor bacteriene care apar ca urmare a morții lor naturale sau a atacului de către componente ale sistemului imunitar. Componentele lipidice minore ale membranelor microbiene sunt utilizate ca markeri. Pe baza conținutului și cantității acestora, până la 170 de specii de bacterii și ciuperci aerobe și anaerobe în diferite medii biologice pot fi determinate în câteva ore.

A fost dezvoltată și este pusă în practică o metodă de analiză GLC, bazată pe determinarea SCFA, care sunt metaboliți ai genurilor de microorganisme în principal anaerobe. Pe baza datelor obținute, a fost creat un pașaport metabolic pentru eubioza intestinală. Metoda vă permite să evaluați rapid și precis starea microflorei indigene.

Creșterea bacteriană intestinală subțire (SIBO) implică creșterea anormală (mai mare de 105 CFU/ml) a bacteriilor endogene în intestinul subțire, similare cu cele care se găsesc în mod normal în colon. Metode directe și indirecte sunt utilizate pentru a diagnostica SIBO. Direct implică inocularea conținutului duodenal și jejunal obținut cu ajutorul unei sonde sterile. O metodă indirectă include studiul emisiilor de hidrogen - un test de respirație. Motivul pentru crearea unui test de respirație cu hidrogen a fost faptul că în timpul metabolismului carbohidraților de către microflora colonului, se formează o cantitate mare de gaze, inclusiv hidrogen. Testul cu hidrogen poate fi folosit pentru a oferi o idee aproximativă a gradului de contaminare bacteriană a intestinului subțire. Cu toate acestea, recent a apărut o opinie că testul de respirație cu hidrogen poate determina doar tranzitul orocecal al bacteriilor.

În prezent, metoda de determinare a tipurilor de microorganisme prin reacția în lanț a polimerazei (PCR) a devenit larg răspândită. Metoda PCR a fost dezvoltată în 1983 de Kary Mullis, pentru care a fost distins cu Premiul Nobel pentru Chimie în 1993. Metoda PCR se bazează pe copierea (amplificarea) repetată a fragmentului de ADN dorit folosind enzima ADN polimerază. În comparație cu metodele tradiționale de diagnostic, PCR este foarte sensibilă și specifică. Permite utilizarea pentru diagnosticarea probelor cu cerințe mai puțin stricte pentru viabilitatea microorganismelor studiate decât pentru cercetarea folosind metode microbiologice. Astăzi există o metodă PCR mai avansată decât cea „clasică” - cu detectarea rezultatelor în timp real. Această metodă se bazează pe măsurarea automată a nivelului semnalului fluorescent, care crește cu fiecare ciclu în timpul unei reacții PCR pozitive, ceea ce permite o evaluare cantitativă a ADN-ului microorganismului studiat într-o probă biologică.

Evoluția oamenilor și a animalelor s-a petrecut în contact permanent cu lumea microbilor, în urma căruia s-au format relații strânse între macro și microorganisme. Influența microflorei gastrointestinale asupra menținerii sănătății umane, a echilibrului său biochimic, metabolic și imunitar este neîndoielnică și a fost dovedită printr-un număr mare de lucrări experimentale și observații clinice. Rolul său în geneza multor boli continuă să fie studiat activ (ateroscleroză, obezitate, sindrom de colon iritabil, boli inflamatorii nespecifice ale intestinului, boala celiacă, cancer colorectal etc.). Prin urmare, problema corectării tulburărilor microflorei este, de fapt, o problemă a păstrării sănătății umane și a creării unui stil de viață sănătos.

Trebuie amintit că tulburările disbiotice sunt întotdeauna secundare. Prin urmare, eliminarea cauzelor, tratarea bolii de bază împotriva căreia se dezvoltă tulburările microbiocenoza intestine, este unul dintre principiile de bază ale corectării sale. Alături de efectul asupra bolii de bază și de creșterea rezistenței organismului, corectarea tulburărilor disbiotice arată: normalizarea funcției motorii intestinale, utilizarea enterosorbanților, prescrierea de medicamente antibacteriene, pre- și probiotice și sibiotice.

Baktistatin®, un medicament complex de origine naturală, un enterosorbent inovator cu efect probiotic, utilizat în practica clinică modernă, are aceste proprietăți.

Medicamentul Baktistatin® constă din trei componente care își îmbunătățesc reciproc efectele. Baza medicamentului este un lichid cultural sterilizat al microbului natural Bacillus Subtilis cu proprietăți medicale și biologice ridicate, care conține substanțe probiotice (lizozim, bacteriocine, catalaze), enzime și aminoacizi. Efectul bactericid și bacteriostatic asupra microbilor patogeni și condiționat patogeni se datorează conținutului de substanțe probiotice sintetizate în timpul creșterii vegetative a bacteriilor din tulpina B. Subtilis și concentrației acestora în lichidul de cultură în timpul fermentației. Astfel, compușii probiotici din Bactistatin® asigură restabilirea microflorei intestinale normale și cresc rezistența nespecifică a organismului.

A doua componentă este zeolitul, un sorbent natural cu proprietăți de schimb ionic. Zeolitul este capabil să prezinte proprietăți de sorbție predominant în raport cu compușii cu greutate moleculară mică (metan, hidrogen sulfurat, amoniac și alte substanțe toxice), fără a intra în interacțiune directă cu vitamine, aminoacizi, proteine, lăsându-le în tractul gastro-intestinal. tract. Ionii conținuți în organism pot fi incluși în structura cristalină a mineralului și, invers, din mineral corpul primește acele elemente anorganice de care are nevoie. Are loc așa-numitul schimb de ioni selectiv. Zeoliții ajută la normalizarea metabolismului grăsimilor, proteinelor și carbohidraților; creșterea imunității; crește rezistența la stres; îmbunătățește funcția de reproducere, funcția celulelor hepatice; normalizează motilitatea intestinală, accelerând mișcarea conținutului intestinal prin tractul digestiv tract.

Baktistatin® conține, de asemenea, hidrolizat de făină de soia, care este o sursă naturală de proteine ​​complete, aminoacizi, oligozaharide și oferă cele mai favorabile condiții pentru creșterea necompetitivă a florei normale și restabilirea peisajului microbian al organismului.

Bactistatin® este eficient în special pentru normalizarea microflorei intestinale în afecțiunile gastrointestinale acute și cronice cu simptome de disbacterioză, în disbacterioza care apare cu sindromul de colon iritabil, ca urmare a terapiei cu antibiotice, și după infecții intestinale.

Literatură

1. Baranovsky A.Yu., Kondrashina E.A. Disbacterioza și disbioza intestinală. - Sankt Petersburg: Petru. - 2000. - P.17

2. Bondarenko V.M., Matsulevici T.V. Disbioza intestinală ca sindrom clinic și de laborator: starea actuală a problemei. - M.: Grupul de editură „GEOTAR-Media”. - 2007. - P.8-35

3. Grigoriev A.V. Tractul gastrointestinal ca habitat al bacteriilor // Sectiunea 1. - M.: Editura: ZAO „SILMA”. - 2004.- P.5-7, P.16-32

4. Korovina N.A., Zakharova I.N., Kostadinova V.N. si altele.Prebiotice si probiotice pentru afectiuni intestinale microbiocenoza la copii. - M.: Editura „Medpraktika-M”. - 2004. - P.8-9

5. Tkachenko E.I., Uspensky Yu.P. Nutriție, microbiocenozași inteligența umană. - Sankt Petersburg: SpetsLit. - 2006. - P.110-113

6. Ursova N.I. Tehnologii moderne în corectarea disbacteriozei la copii. - Tutorial. - Moscova. - 2003. - P.4-6.

7. Eckburg P.B., Bik E.M., Bernstein C.N. et al. Diversitatea florei microbiene intestinale umane. // Știință. 2005. - 308.- R.1635-1638.

8. Ghoshal U.C., Park H., Gwee K.-A. Bug-uri și sindromul intestinului iritabil: binele, răul și urâtul. // J Gastroenterologie, Hepatologie. - 2010. - 25 (2). - P.244-251.

9. O’Hara A.M., Shanahan F. Review. Microflora intestinală: analiză potenţial terapeutic. // Gastroenterologie clinică și hepatologie. editie ruseasca. - 2008.- Volumul 1, Nr 4: 236-247.

10. Spiller R.S. Articol de recenzie: Probiotice și prebiotice în sindromul intestinului iritabil // Farmacologie alimentară și terapie. 2008; 28(4):385-396.

Infecțiile intestinale acute (IA) sunt răspândite în întreaga lume și se caracterizează prin răspândire fecal-oral (alimentară, apoasă) sau casnică și localizarea primară a agentului patogen în intestin. Acestea sunt boli polietiologice, ai căror agenți cauzali aparțin diferitelor grupe de microorganisme (bacterii, ciuperci, viruși, protozoare).

Patogenii bacterieni ai infecțiilor intestinale acute includ reprezentanți ai următoarelor familii:

1.Enterobacteriaceae :

Gen Shigella , ai căror reprezentanți provoacă infecție antroponotică - dizenterie.

Gen Salmonella , ai caror reprezentanti provoaca infectii antroponotice - febra tifoida si febra paratifoida A si B si zooantroponoze - salmoneloza.

Gen Escherichia

Diareegen E. coli, provocând Escherichioza.

Gen Iersinia , provocând yersinioză intestinală și pseudotuberculoză.

Bacterii un fel de Klebsiella spp, Proteus spp, Enterobacter spp, Citrobacter spp - care provoacă boli de origine alimentară.

2. Vibrionaceae

Gen Vibrio - V. holerae 0,1 sau 0139, care provoacă holera și vibrioni oportuniști, agenți cauzali ai diareei vibriogene.

3. Camphylobacteriaceae

GenCamphylobacter (C. jejuni, C. colisi etc.), provocând zooantroponoze – campilobacterioză. Gen Helicobacter (H. pylori, asociate cu ulcere gastrice și duodenale).

4. Baccililaceae.

Gen Bacil (B . cereus, provocând toxiinfecții alimentare).

5. Clostridiaceae

GenClostridium (CU.botulinum, C. dificilae)- provocând enterocolită pseudomembranoasă indusă de antibiotice.

6. Stafilococee

Gen Stafilococ (S. Aureus), producând enterotoxină. Când o cantitate mare de enterotoxină intră în organism cu alimente, se dezvoltă toxicoza alimentară stafilococică.

Viruși- agenții cauzali ai infecțiilor intestinale acute sunt rotavirusurile, virusul Norwalk, unele serovare de adenovirusuri, enterovirusurile, inclusiv virusul hepatitei A și virusul hepatitei E.

Microfloră gastrointestinală normală

Există o distribuție particulară a microflorei în sistemul digestiv. De-a lungul tractului gastrointestinal, se disting mai multe biotopi care diferă semnificativ în compoziția microbiocenozei, care este asociată cu diferite caracteristici morfologice, funcționale și biochimice ale secțiunilor corespunzătoare ale tractului gastrointestinal.

Esofag. Microflora esofagului este săracă. Partea proximală este contaminată cu bacterii tipice microflorei cavității bucale și faringelui; în părțile distale se găsește. Staphylococcus spp., difteroizi, Sarcina spp.B. subtilis, ciuperci din genul Candida.

Stomac. Practic nu există bacterii în stomac, numărul lor nu depășește 10 3 ml de conținut. Acest lucru se datorează acțiunilor acidului clorhidric, lizozimei și enzimelor. Un număr mare de bacterii sunt detectate în partea pilorică. Este prezentată compoziția speciei Lactobacillus spp, Bifidobacterium spp, Bacteroides spp, Streptococcus spp, ciuperci asemănătoare drojdiei, Sarcina spp., Enterococcus spp., Pseudomonas spp., Bacteroides spp.

Intestinele.În duoden, numărul de bacterii nu este mai mare de 10 4 - 10 5 CFU la 1 ml de conținut. Microflora prezentată Lactobacillus spp, Bifidobacterium spp, Bacteroides spp, Enterococcus spp. Unele dintre ele vin cu mase alimentare, altele din părțile superioare ale intestinului subțire.

În părțile superioare ale intestinului subțire, microorganismele sunt detectate în cantitate mică de 10 4 CFU/ml. Principalul mecanism care împiedică creșterea bacteriilor în intestinul subțire este acțiunea bilei, a enzimelor, a peristaltismului intestinal și a secreției de imunoglobuline în lumenul intestinal. Pe măsură ce vă deplasați spre partea distală a intestinului subțire, efectul factorilor bactericid și bacteriostatic slăbește și se creează condiții favorabile pentru bacterii la intrarea în intestinul gros (anumite pH, temperatură, multe substraturi nutritive), ceea ce contribuie la intensificarea lor. reproducere. În legătură cu aceasta și prezența unui număr mare de produse de carie, microflora normală constantă a intestinului gros la adulți ocupă primul loc ca număr (10 11 - 10 12 CFU / g de fecale) și diversitate (mai mult de 100 de tipuri diferite de microorganisme în mod constant)

Deoarece condițiile anaerobe sunt create în acest biotop la o persoană sănătoasă, predomină compoziția microflorei normale din intestinul gros (96-99%), bacterii-bacteriide anaerobe, C.Rerfringens, streptococ spp, Fubacterium spp, Veilonella spp,Gemella spp, Peptostreptococcus spp.Lactobacillus spp, doar până la 4% din microfloră sunt microorganisme anaerobe facultative aerobe E. coli, Enterobacteriaceae spp., în cantități mici Staphylococcus spp, Proteus spp, Pseudomonas spp, ciuperci din genul Candida spp, specii individuale Treponem spp, Mycobacterium spp, Mycoplasma spp, Actinomyces spp, protozoare și viruși.

Căile biliare. Ficat. La oamenii sănătoși, microbii sunt de obicei absenți din căile biliare.

Boli gastrointestinale nespecifice

Boli gastrointestinale nespecifice - diaree, colită nespecifică, sindrom de sorbție slabă, duodenită, ulcer gastric, gastrită, gastroenterită, colangită, colecistită, esofagită. Ele sunt adesea asociate cu enterovirusuri, rotavirusuri, amebiaza, balantidiaza, afte și candidoza intestinală.

Microbiologia gastroenterocolitei- inflamație a mucoaselor stomacului și intestinului subțire. Factorul etiologic este Enterobacterium spp, Staphylococcus spp, Clostridium spp, Bacillus spp, Camphylobacterie spp, Iersinia spp,Vibrio spp, rotavirusuri, enterovirusuri.

Microbiologia gastritei- afectarea mucoasei gastrice, însoțită de disfuncție . Se asociază gastrită, ulcere gastrice și duodenale CuH. pylori.

Microbiologia esofagitei - inflamație a membranei mucoase a esofagului. Principalul agent patogen C. albicans, virusuri herpes simplex, citomegalovirusuri.

Microbiologia colecistitei- inflamație a vezicii biliare, predominant de origine bacteriană ( E . coli , S. aureus, Enterococ spp, Streptococcus spp., Proteus spp, ciuperci asemănătoare drojdiei, floră mixtă.).

Diagnosticul microbiologic. Principala metodă de diagnostic microbiologic pentru infecțiile intestinale acute este examenul bacteriologic.

Colectia materialelor:

Fecalele sunt colectate în recipiente sterile urmând reguli aseptice. În cazul defecării naturale, recoltarea se face din scutece sau dintr-o oală cu spatulă sterilă montată într-un dop de bumbac al unei eprubete;

Materiile fecale pot fi colectate din rect folosind un tub rectal, care se introduce 8-10 cm;

În timpul unei examinări preventive a persoanelor sănătoase pentru transportul tifoid-paratifoid, persoana examinată trebuie să primească 25-30 g de sulfat de magneziu, care este un coleretic și laxativ, cu 3 ore înainte de începerea colectării materialului;

Materialul este colectat atunci când apar primele semne ale bolii, înainte de începerea tratamentului cu antibiotice. Este recomandabil să se efectueze colectarea și însămânțarea inițială a materialului în camera de urgență; acesta trebuie livrat la laborator în cel mult 2 ore de la colectare, în caz contrar trebuie păstrat la frigider. Dacă însămânțarea imediată nu este posibilă, materialul colectat este plasat în eprubete cu soluție de conservare;

Transportul trebuie efectuat cu respectarea regulilor de precauție necesare - în genți, cutii de creioane;

Materialul este prelevat din esofag și stomac în timpul esofagoscopiei și gastroscopiei;

Conținutul intestinului subțire este colectat folosind o sondă. Eșantionul este examinat în cel mult o oră de la recoltare;

La escherichioza enterică- este vorba de fecale, material de rozeola, urină, bilă, vărsături;

La escherichioza parenterală- scurgeri purulente, urină, spută, sânge în forme septice;

Infecții tifoide-parotide, alegerea materialului este determinată de faza de patogeneză:

Faza de bacteriemie (1 săptămână) sânge,

Înălțimea bolii (2,3 săptămâni): sânge, puncție de măduvă osoasă, răzuire rozeolei;

Faza excretor-alergică (săptămâna a 4-a): sânge (în caz de recidivă), fecale, urină, bilă;

bilă colectate în tuburi sterile prin sondarea duodenului. În acest caz, conținutul duodenal, bila chistică și bila din căile biliare sunt colectate separat (lot A, B, C);

- rozeola se scarifica, materialul luat se inoculează pe bulion de bilă;

Recoltarea urinei, LCR, biopsii de măduvă osoasă, spută - descrise în secțiunile relevante.

Diagnosticul microbiologic

Examinarea de laborator a fecalelor începe cu o examinare caprologică preliminară, pentru aceasta este necesar:

Pregătiți frotiuri din fecale, colorați-le cu albastru de metilen pentru a identifica leucocite, ceea ce indică deteriorarea mucoasei intestinale;

Efectuați o analiză microscopică a unui frotiu fecal nativ pentru vierme, deoarece helmintiazele pot apărea cu tabloul clinic al infecțiilor intestinale acute;

Efectuați analize microscopice pe protozoare (amoeba, lamblia, criptosporidium).

Examenul bacteriologic al fecalelor pentru suspiciunea de infecții intestinale acute

Caracteristicile evenimentului etapa 1 Examenul bacteriologic pentru infecții intestinale acute suspectate constă în următoarele:

Nu se efectuează microscopia primară a frotiurilor fecale;

Având în vedere polietiologia OCI, pentru izolarea unei culturi pure, semănatul diluțiilor fecalelor se face pe medii de diagnostic diferențial (Endo, Levin, Ploskireva, agar bismut-sulfit și medii de îmbogățire).

La etapa 2 cercetare bacteriologică

Se selectează coloniile lactoză negative crescute (incolore). Sunt formate din salmonella, shigella;

Coloniile lactoză pozitive (colorate) care au dat Escherichia sunt îndepărtate cu grijă cu o ansă și se realizează o reacție de aglutinare cu acestea cu ser complex polivalent de Escherichia pentru diferite serogrupuri patogene. Coloniile cu care s-a înregistrat un rezultat pozitiv, atunci când reacţionează cu serul corespunzător, sunt eliminate pentru acumulare pe o înclinare a agarului.

Cultura acumulată este identificată la gen și specie pe baza unui set de proprietăți biochimice:

În caz de suspiciune de yersinioză, inocularea primară se efectuează pe mediul lui Serov, urmată de îmbogățirea la rece (inoculările se pun la frigider, urmate de însămânțare pe medii nutritive solide);

Dacă se suspectează campilobacterioza, însămânțarea primară se efectuează pe medii nutritive speciale cu adaos de antibiotice. Culturile sunt incubate în anaerostate;

Pentru diagnosticul bacteriologic al holerei, materialul de la pacient este inoculat pe un mediu electiv (1% apă peptonă, agar alcalin);

Pentru a diagnostica bolile cauzate de C. difficile exotoxina se găsește în fecalele pacienților. Se folosesc metode ELISA sau genetice moleculare.

Dacă se suspectează o boală alimentară, însămânțarea inițială a materialului se efectuează pe mai multe medii specifice:

Semănat pe mediu Endo - pentru a izola enterobacterii;

Semănat conform lui Shchukevich - pentru a izola Proteus;

Semănat pe ZhSA - pentru izolare S. aureus,

Cultură pe agar sânge pentru izolarea streptococilor;

Semănat pe mediu Kitt-Tarrotsi pentru a izola anaerobii.

Semănat pe mediu Sabouraud pentru a izola ciuperci.

Pentru diagnosticul microbiologic al infecțiilor intestinale acute se mai folosesc următoarele: serodiagnostic - adesea efectuat retroactiv.

Imunoindicatie - reacție de imunofluorescență, aglutinare latex, coaglutinare.

În proximal cantități mici de bacterii pot fi găsite în părți ale esofagului, trăind în orofaringe, în secțiunile distale - stafilococi, difteroizi, bacterii lactice, sarcina, Bacillus subtilis și candida. Examenul bacteriologic este efectuat pentru a identifica agenții cauzali ai esofagitei. Principalii agenți patogeni sunt HSV, CMV și ciupercile din genul Candida.

Pentru infecția cu herpes indică ulcere mici și multiple profunde; cu infecția cu CMV sunt mai mari și predispuse la fuziune. Esofagita candida este tipică pentru pacienții cu afecțiuni severe de imunodeficiență. Pentru a izola candida, se prelevează biopsii în timpul esofagoscopiei, se examinează microscopic frotiurile colorate cu Gram, iar materialul este inoculat pe medii nutritive.

Examenul bacteriologic al stomacului

Bacteriile din stomac practic absentă, sau cantitatea lor nu depășește 10 3 -10 4 ml de conținut, ceea ce se datorează pH-ului acid. Un număr mai mare de bacterii este detectat în partea pilorică. În caz de hipoclorhidrie, în stomac sunt detectate lactobacili, sarcina, enterobacterii, Pseudomonas aeruginosa, enterococi, bacili formatori de spori și diverse ciuperci. De o importanță deosebită este Helicobacter pylori, agentul cauzal al gastroduodenitei ulcerative recurente.

Pentru detectarea H. pylori Prelevarea de probe de biopsie în timpul fibrogastroscopiei este considerată cea mai optimă. La boli transmise prin alimente cauzate de S. aureus si B. cereus, studiaza apele de lavaj gastric, care se examineaza imediat. Probele sunt centrifugate, sedimentul este examinat microscopic și inoculat pe medii nutritive. Dacă analiza imediată nu este posibilă, pH-ul probelor este ajustat la valori neutre și înghețat. Vărsăturile se livrează la laborator pe gheață; Dacă este necesar, pot fi congelate.

FUNCȚIILE DE BAZĂ ALE MICROFLOREI NORMALE A tractului intestinal

Microflora normală (normoflora) a tractului gastrointestinal este o condiție necesară pentru viața organismului. Microflora tractului gastrointestinal în înțelegerea modernă este considerată microbiomul uman...

Normoflora(microfloră în stare normală) sauStarea normală a microflorei (eubioza) - este calitativ și cantitativraportul dintre diversele populații microbiene ale organelor și sistemelor individuale, menținând echilibrul biochimic, metabolic și imunologic necesar pentru menținerea sănătății umane.Cea mai importantă funcție a microflorei este participarea acesteia la formarea rezistenței organismului la diferite boli și asigurarea prevenirii colonizării corpului uman de către microorganisme străine.

Tractul gastrointestinal este unul dintre cele mai complexe medii microecologice ale corpului uman, în care, pe suprafața totală a membranei mucoase, care este de aproximativ 400 m2, există o diversitate excepțional de mare și diversă (peste 1000 de specii)bacterii eterogene, viruși, arhee și ciuperci - ed.) densitatea contaminării microbiene, în care interacțiunea dintre sistemele de protecție ale macroorganismului și asociațiile microbiene este foarte fin echilibrată. Se crede că bacteriile reprezintă 35 până la 50% din volumul colonului uman, iar biomasa lor totală în tractul gastrointestinal se apropie de 1,5 kg.Cu toate acestea, bacteriile sunt distribuite neuniform în tractul gastrointestinal. Dacă densitatea colonizării microbiene în stomac este scăzută și este de numai aproximativ 10 3 -10 4 CFU/ml, iar în ileon - 10 7 -10 8 CFU/ml, apoi deja în zona valvei ileocecale din colon, gradientul de densitate bacteriană ajunge la 10 11 -10 12 CFU/ml. În ciuda unei varietăți atât de mari de specii bacteriene care trăiesc în tractul gastrointestinal, cele mai multe pot fi identificate doar genetic molecular.

De asemenea, în orice microbiocenoză, inclusiv intestinală, există întotdeauna specii vii de microorganisme. - 90% , legat de așa-numitul microflora obligatorie ( sinonime: microflora principală, autohtonă, indigenă, rezidentă, obligatorie), care are un rol principal în menținerea relației simbiotice dintre macroorganism și microbiota acestuia, precum și în reglarea relațiilor intermicrobiene, și există și suplimentare (microflora însoțitoare sau facultativă) - aproximativ 10% și tranzitorie (specii aleatoare, alohtone, microfloră reziduală) - 0,01%.

Principal tipuri microbiota intestinală sunt Firmicutes, Bacteriodetes, Actinobacteria, Proteobacteria, Fusobacteria, Verrucomicrobia, TenericutesȘi Lentisphaerae.

Dintre bacteriile comensale cultivate din tractul gastrointestinal, mai mult de 99,9% sunt anaerobi obligatorii, dintre care dominantele sunt naştere : Bacteroides, Bifidobacterium, Eubacterium, Lactobacillus, Clostridium, Faecalibacterium, Fusobacterium, Peptococul, Peptostreptococul, Ruminococcus, streptococ, EscherichiaȘi Veillonella. Compoziția bacteriilor detectate în diferite părți ale tractului gastrointestinal este foarte variabilă.

Crește densitate microorganismele și diversitatea biologică a speciilor se observă de-a lungul tractului gastrointestinal în direcția caudal-cervicală. De asemenea, se observă diferențe de compoziție intestinală între lumenul intestinal și suprafața mucoasei. Bacteroides, Bifidobacterium, Streptococcus, Enterococcus, Clostridium, Lactobacillus și Ruminococcus sunt predominante naştere in lumenul intestinal, in timp ce Clostridium, Lactobacillus, Enterococcus si Akkermansia sunt predominante pe suprafata asociata cu mucoasa - i.e. AcestȘimicrobiota, respectiv (sau în alt mod - luminal și mucoasa). Microbiota asociată mucoasei joacă un rol foarte important în menținerea homeostaziei, având în vedere apropierea sa de epiteliul intestinal și de sistemul imunitar al mucoasei subiacent.3 ]. Această microbiotă poate juca un rol important în menținerea homeostaziei celulare gazdei sau în declanșarea mecanismelor inflamatorii.

Odată stabilită această compoziție, microbiota intestinală rămâne stabilă pe tot parcursul vieții adulte. Au fost observate unele diferențe între microbiota intestinală a adulților mai în vârstă și a adulților mai tineri, în special în ceea ce privește predominanța naştere Bacteroides și Clostridium la vârstnici și tip Firmicutes la tineri. Au fost propuse trei variante ale microbiotei intestinale umane, clasificate ca enterotipuri pe baza variaţiilor nivelurilor unuia din trei naştere: Bacteroides (enterotip 1), Prevotella (enterotip 2) și Ruminococcus (enterotip 3). Aceste trei variații par a fi independente de indicele de masă corporală, vârstă, sex sau etnie [, ].

În funcție de frecvența și consistența detectării bacteriilor, toată microflora este împărțită în trei grupuri (Tabelul 1).

Tabelul 1. Microbiocenoza tractului gastrointestinal.

Cu toate acestea, o astfel de împărțire este extrem de arbitrară. Direct în colon La om, bacteriile din genurile Actinomyces, Citrobacter, Corynebacterium, Peptococcus, Veillonella, Acidominococcus, Anaerovibrio, Butyrovibrio, Acetovibrio, Campylobacter, Disulfomonas, Roseburia, Ruminococcus, Selenomonas, Spirochetes, Succilla sunt prezente în cantități variate, Wolinella. Pe lângă aceste grupuri de microorganisme, puteți găsi și reprezentanți ai altor bacterii anaerobe (Gemiger, Anaerobiospirillum, Metanobrevibacter, Megasphaera, Bilophila), diverși reprezentanți ai genurilor de protozoare nepatogene Chilomastix, Endolimax, Entamoeba, Enteromonas) și mai mult de zece intestinale. virusuri (mai mult de 50% dintre oamenii sănătoși au una și aceleași 75 de specii de bacterii, iar peste 90% dintre bacteriile de colon aparțin fililor Bacteroidetes și Firmicutes - Qin, J.;et al. Un catalog de gene microbiene intestinale umane stabilit prin secvențierea metagenomică.Natură.2010 , 464 , 59-65.).

După cum sa menționat mai sus, împărțirea microorganismelor gastrointestinale în grupuri de „constanță și importanță” este foarte arbitrară. Știința nu stă pe loc, ținând cont de apariția unor noi metode independente de cultură de identificare a microbiotei (secvențiere ADN, hibridizare fluorescentă in situ (PEŞTE), utilizarea tehnologiei Illumina etc.), și reclasificarea unui număr de microorganisme efectuate în legătură cu aceasta, viziunea asupra compoziției și rolului microbiotei intestinale umane sănătoase s-a schimbat semnificativ. După cum sa dovedit, de compoziția microbiomului gastrointestinal depinde persoană accesorii. A apărut și o nouă idee despre specia dominantă - o rafinată arbore filogenetic microbiota tractului gastrointestinal uman (despre aceasta și multe altele, vezi secțiunile „” și „ ".

Există o relație strânsă între coloniile de microorganisme și peretele intestinal, ceea ce le permite să fie combinate într-un singurcomplex microbian-ţesut, care este format din microcolonii de bacterii și metaboliții pe care îi produc, mucus (mucină), celule epiteliale ale membranei mucoase și glicocalixul acestora, precum și celule stromale ale membranei mucoase (fibroblaste, leucocite, limfocite, celule neuroendocrine, celule microcirculatorii). , etc.). Este necesar să ne amintim existența unei alte părți populaționale a microflorei -abdominale(sau după cum s-a menționat mai sus - luminos), care este mai variabilă și depinde de rata de intrare a substraturilor alimentare prin canalul digestiv, în special fibrele alimentare, care sunt substrat nutritiv și joacă rolul unei matrice pe care se fixează bacteriile intestinale și formează colonii. cavitate (luminală) Floră domină în microflora fecală, ceea ce face necesară evaluarea modificărilor diferitelor populații microbiene detectate în timpul examenului bacteriologic cu extremă precauție.

Stomacul conține puțină microfloră, mult mai mult în intestinul subțire și mai ales mult în intestinul gros. Este demn de remarcat faptul că aspiraţie solubil în grăsime substanțele, cele mai importante Vitaminele și microelementele apar în principal în jejun. Prin urmare, includerea sistematică în dieta a produselor probiotice și a suplimentelor alimentare, caremodulează microflora intestinală (microbiota), reglând procesele de absorbție intestinală,devine un instrument foarte eficient în prevenirea și tratarea bolilor de nutriție.

Absorbția intestinală- acesta este procesul de intrare a diverșilor compuși printr-un strat de celule în sânge și limfă, în urma căruia organismul primește toate substanțele de care are nevoie.

Cea mai intensă absorbție are loc în intestinul subțire. Datorită faptului că arterele mici care se ramifică în capilare pătrund în fiecare vilozitate intestinală, nutrienții absorbiți pătrund ușor în fluidele corpului. Glucoza și proteinele descompuse în aminoacizi sunt absorbite în sânge mediocru. Sângele purtător de glucoză și aminoacizi este trimis la ficat, unde se depun carbohidrați. Acizii grași și glicerolul - un produs al procesării grăsimilor sub influența bilei - sunt absorbiți în limfă și de acolo intră în sistemul circulator.

În poza din stânga(diagrama structurii vilozităților intestinului subțire): 1 - epiteliu columnar, 2 - vas limfatic central, 3 - rețea capilară, 4 - membrana mucoasă, 5 - submucoasa, 6 - placa musculară a membranei mucoase, 7 - glanda intestinală, 8 - canal limfatic .

Unul dintre semnificațiile microflorei colon este că participă la descompunerea finală a reziduurilor alimentare nedigerate.În intestinul gros, digestia se termină cu hidroliza reziduurilor alimentare nedigerate. În timpul hidrolizei în intestinul gros, sunt implicate enzimele care provin din intestinul subțire și enzimele din bacteriile intestinale. Are loc absorbția apei, sărurilor minerale (electroliți), descompunerea fibrelor vegetale și formarea fecalelor.

Microflora joacă un rol semnificativ (!) înperistaltismul, secretia, absorbtia si compozitia celulara a intestinului. Microflora este implicată în descompunerea enzimelor și a altor substanțe biologic active. Microflora normală oferă rezistență la colonizare - protecția mucoasei intestinale de bacteriile patogene, suprimând microorganismele patogene și previn infecția organismului.Enzimele bacteriene descompun substanțele nedigerate în intestinul subțire. Flora intestinală sintetizează vitamina K și vitaminele B, un număr de de neînlocuit aminoaciziși enzimele necesare organismului.Odată cu participarea microflorei în organism, are loc schimbul de proteine, grăsimi, carbon, bilă și acizi grași, colesterolul, procarcinogenii (substanțe care pot provoca cancer) sunt inactivați, se utilizează excesul de hrană și se formează fecale. Rolul florei normale este extrem de important pentru organismul gazdei, motiv pentru care perturbarea acesteia (disbacterioza) si dezvoltarea disbiozei in general duce la boli grave de natura metabolica si imunologica.

Compoziția microorganismelor din anumite părți ale intestinului depinde de mulți factori: stilul de viață, alimentația, infecțiile virale și bacteriene, precum și tratamentul medicamentos, în special antibiotice. Multe boli gastrointestinale, inclusiv bolile inflamatorii, pot perturba, de asemenea, ecosistemul intestinal. Rezultatul acestui dezechilibru sunt probleme digestive frecvente: balonare, indigestie, constipație sau diaree etc.

Pentru mai multe informații despre rolul microbiomului intestinal în menținerea sănătății gastrointestinale, consultați articolul: (vezi incl. link-uri din partea de jos a acestei secțiuni).

În figură: Distribuția spațială și concentrația bacteriilor de-a lungul tractului gastrointestinal uman ( date medii).

Microflora intestinală (microbiomul intestinal) este un ecosistem incredibil de complex. Un individ are cel puțin 17 familii de bacterii, 50 de genuri, 400-500 de specii și un număr nedefinit de subspecii. Microflora intestinală este împărțită în obligatorie (microorganisme care fac parte constant din flora normală și joacă un rol important în metabolism și protecție antiinfecțioasă) și facultativă (microorganisme care se găsesc adesea la oamenii sănătoși, dar sunt oportuniste, adică capabile să provoace boli la reducerea rezistenței macroorganismului). Reprezentanții dominanti ai microflorei obligatorii sunt bifidobacterii.

Tabelul 1 prezintă cele mai faimoasefuncțiile microflorei intestinale (microbiota), în timp ce funcționalitatea acesteia este mult mai largă și este încă studiată